此項研究新發(fā)現(xiàn)了許多番茄miRNA,有助于研究人員對ELISA試劑盒介導調控網(wǎng)絡的深入理解,并為病毒致病機制提供了新見解。
研究人員分別構建了兩個獨立的小RNA文庫,并進行高通量測序(小RNA測序項目由聯(lián)川生物承擔完成)。基于測序分析和發(fā)夾結構的預測,共有50個植物ELISA試劑盒和273個潛在候選的miRNA(PC-miRNA)在番茄中被鑒定出來,ELISA試劑盒其中12個植物miRNA和80個PC-miRNA分別來自一個前體序列的3p和5p鏈。因此,該病毒感染可能導致災難性的作物損失。
ELISA試劑盒在植物發(fā)育和應激反應過程中起重要調節(jié)作用。雖然目前已有可獲得番茄基因組信息的數(shù)據(jù)庫,ELISA試劑盒但已經確定的番茄miRNA的數(shù)量有限。15個新發(fā)現(xiàn)的西紅柿miRNA)和40個PC-miRNA在兩個庫之間存在差異表達,同時一些新發(fā)現(xiàn)的番茄miRNA和PC-miRNA的表達模式通過qRT-PCR方法得到進一步驗證。
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